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RNA测序服务

外泌体RNA测序

发布时间 2017-09-14

　　外泌体作为活细胞分泌的含有RNA和蛋白质的微囊，广泛分布于外周血、尿液、唾液、腹水、羊水等多种体液中。最新研究表明，体液中外泌体RNA（特别是miRNA等非编码RNA）在不同的疾病模型中存在明显的表达差异。同时，这些分子被外泌体的脂膜所包裹和保护，能保持其原有稳定性和生物学功能，有望成为液体活检的重要分子标志物。通过高通量技术对外泌体RNA进行测序，可快速高效获得外泌体RNA的全面信息，是疾病诊断和随访的理想手段。

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样本要求

测序策略

交付周期

样品类型: Total RNA、细胞上清、血液、尿液等

样品浓度: ≥500pg/μl,细胞上清≥30ml，血液≥3ml

样品总量: ≥3ng

测序模式：Hiseq3000/4000(PE150)

测序深度：10-16G clean data

60天

　　注：分离外泌体前的样品不能加入任何RNA保护剂（如TRIzol，RNAlater）；血清，血浆，外泌体等样品属于特殊样品，提取风险较大，博越致和不承诺提取的成功率。其他特殊样品请与销售或技术支持联系。

　　提取优势：领先的外泌体提取技术，全面提升外泌体的产量和纯度；

　　样品兼容性强：广泛样品兼容性，适用于血清，血浆，尿液，细胞培养上清等。

　　健康及癌症病人血浆中胞外囊泡的RNA表达谱研究

　　研究背景:

　　胞外囊泡会选择性包装RNA，可以作为潜在疾病生物标志物。研究通过对血浆胞外囊泡中的RNA进行测序分析，来挖掘具有生物标识物潜力的RNA。

　　研究内容:

　　为了系统地描述循环系统RNA（exRNA）表达情况。我们对来源于50名健康个体和142名癌症患者血浆的胞外囊泡进行了RNA测序分析，每个样本测序深度约1260万原始测序读长。

　　研究结果:

　　Mapping处理发现约540万个 RNA，包括微RNA（约40.4％），piRNAs（约40.0％），lncRNAs（约2.4％），tRNA（约2.1％）和mRNA（约2.1％）；

　　通过表达稳定性分析，研究发现了一组miRNA在不同的样本中有相对一致的表达丰度；

　　通过协方差多因素分析，研究发现exRNAs与年龄，性别和不同类型的癌症显著的相关。下调的miR-125a-5p和miR-1343-3p显示出与所有测试的癌症类型的关联（FDR<0.05）；

　　研究为exRNA提供了一些基准参考信息，同时也发现了具有成为生物标识物潜力的RNA。

图1. 转录组分析外泌体中RNA的种类

　　1. Yuan T, Huang X, Woodcock M, et al. Plasma extracellular RNA profiles in healthy and cancer patients[J]. Scientific Reports, 2016, 6:19413.

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