宏基因组测序，是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序，以分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。而所谓宏基因组学就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法，解读微生物群体多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。

样本要求	测序策略	交付周期
样品类型: 环境微生物DNA样品 样品浓度: ≥50 ng/μl 样品总量: ≥3 μg	测序模式: Hiseq/Miseq双端测序 测序深度: 5-10G clean data	60天

　　全球海洋微生物结构与功能

　　研究背景：

　　微生物是生物化学主要动力，但对它们的微生物种群结构、功能多样性以及生态因素进行总体分析还存在很大挑战。

　　研究内容：

　　对全球主要代表性海洋区域（除北极外）68个采样点分三层 （表层SRF，最低光合作用层DCM，中层MESO）不同海水中采集243份样品。提取DNA，进行Illumina PE100进行测序，进行OTU聚类和分析以及一些功能基因预测，菌群结构和功能分析。结合生态学、系统生物学和海洋学来研究海洋中浮游生物。

　　研究结论：

　　研究发现温度是微生物物种多样性最大的驱动力，海洋微生物中广泛的功能预示其影响全球气候变化的潜力。

图1. 研究发现全球海洋微生物多样性

 

　　1. B?ckhed F, Roswall J, Peng Y, et al. Dynamics and Stabilization of the Human Gut Microbiome during the First Year of Life[J]. Cell Host & Microbe, 2015, 17(5):690-703.