基因组甲基化测序（Bisulfate Sequencing, BS-seq）是指利用重亚硫酸盐对全基因组DNA 进行处理，可使未甲基化修饰的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基，然后利用高通量测序在全基因组范围内检测所有的甲基化位点，绘制单碱基分辨率的DNA 甲基化图谱。通过全基因组甲基化测序可以全面了解胚胎发育、衰老、疾病过程中表观遗传差异的作用机理，为相关研究提供指导。

　　DNA甲基化导致基因组上转录因子结合位点丢失

　　研究背景:

　　肿瘤发生往往伴有DNA甲基化模式异常。特定的甲基化模式往往和特定的DNA突变相对应。急性早幼粒细胞白血病（APL）疾病进程中甲基化变化一直没有明确的研究结果。

　　研究结果:

　　原始甲基化水平数据可以将样本聚类为两类APL患者和复发患者与其它样品这两类。同时，RRBS的结果和甲基化芯片结果具有很好的相关性（图1）。

图1. 基于甲基化水平测序原始数据聚类图显示样品的聚类情况

　　2. APL患者整体甲基化水平偏高，但染色体末端甲基化程度降低。

　　3. PML-RARalfa结合位点并不一定是甲基化水平差异位点，预测是PML-RARalfa的结合保护了结合位点被过度甲基化。

　　4.小鼠和细胞实验表明，白血病发病和表型的晚期事件和甲基化变化存在紧密关联。

　　研究结论:

　　APL疾病发生伴有DNA高甲基化和整体甲基化水平变异增加，同时染色体末端区域存在甲基化水平降低。APL疾病，部分基因组因为DNA甲基化免于被促癌转录因子的结合，如PML-RARalfa。PML-RARalfa引发白血病发生与甲基化水平改变事件是相互独立的。

　　1. Schoofs T, Rohde C, Hebestreit K, et al. DNA methylation changes are a late event in acute promyelocytic leukemia and coincide with loss of transcription factor binding.[J]. Blood, 2013, 121(1):178-87.