宏基因组测序，是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序，以分析微生物群体基因组及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。

全球海洋微生物结构与功能

研究背景：

微生物是生物化学主要动力，但对它们的微生物种群结构、功能多样性以及生态因素进行总体分析还存在很大挑战。

研究内容：

对全球主要代表性海洋区域（除北极外）68个采样点分三层 （表层SRF，最低光合作用层DCM，中层MESO）不同海水中采集243份样品。提取DNA，进行Illumina PE100进行测序，进行OTU聚类和分析以及一些功能基因预测，菌群结构和功能分析。结合生态学、系统生物学和海洋学来研究海洋中浮游生物。

研究结论：

研究发现温度是微生物物种多样性最大的驱动力，海洋微生物中广泛的功能预示其影响全球气候变化的潜力。

图1. 研究发现全球海洋微生物多样性

1. Backhed F, Roswall J, Peng Y, et al. Dynamics and Stabilization of the Human Gut Microbiome during the First Year of Life[J]. Cell Host & Microbe, 2015, 17(5):690-703.