单细胞测序（Single-cell sequencing）是在单细胞水平对基因进行扩增与测序，并对获得的数据进行生物信息学分析的一项新技术。单细胞测序可针对性揭示单个细胞基因结构信息，成功解决了用组织样本测序难以解决的细胞异质性（heterogeneity）难题，可用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。

单细胞转录组测序揭示人CD127+先天淋巴细胞的异质性

研究背景：

先天淋巴细胞（ILCs）是一种免疫细胞，它通过释放可溶性的因素调节对病毒、细菌和寄生虫的早期免疫反应。这些细胞可以根据细胞表面的转录因子及细胞因子被分为三个亚型，每种亚型都有不同的功能。

研究内容：

用流式细胞仪分选患有阻塞性睡眠呼吸暂停综合症患者的扁桃体组织中的ILCs （Lin?CD127+）和NK cells（CD45+Lin?CD127? NKG2A+CD56+CD16?），进行单细胞测序，通过序列比对，基因差异表达分析以及细胞分型，来挖掘新的免疫细胞。

图1. ILC1、ILC2、ILC3差异基因表达分析

研究结论：

本研究通过对648个单细胞进行单细胞转录组的分析，应用t-SNE细胞分型、SCDE基因差异表达分析，在ILC3中发现新的免疫细胞CD62L+ ILC3。

1. Asa K Bjorklund, Forkel M, Picelli S, et al. The heterogeneity of human CD127+ innate lymphoid cells revealed by single-cell RNA sequencing [J]. Nature Immunology, 2016, 17(4):451-460.